DNA是一种纳米级的物质,它由A 、T、G、C 四种碱基组成,它的形状就像是一个双螺旋的小梯子。然而,DNA一定是这种双螺旋结构吗?非也,DNA 可以被折叠为任何3D的形状。
来自麻省理工等大学的科学家们通过一个特殊算法实现了这一切。整个过程就像是以DNA 的碱基为材料进行纳米级的3D打印。本期,3D科学谷将与谷友一起来了解一下这个3D DNA 是怎样实现的,以及科学家这样做的意义。
如果是单链的DNA并不会形成双螺旋结构,而是以一定的空间扭曲存在。麻省理工的科学家正是利用了这一点,通过通过一个巧妙地算法来设计DNA中A、T、G和C碱基的位置,使DNA碱基扭向指定的方向,或者说是让DNA 单链进行足够的弯曲和缠绕从而形成一个3D 几何结构。
其中最大的难度在于如何设计出这些几何结构,比如,仅仅让DNA链组成一个十二面体就是一个极其复杂的任务,几乎没有人有经验能够手工组装如此复杂的分子,这些分子往往由数以千计的碱基对组成。而这正是科学家们需要解决的问题。
科学家们研究出一种DNA折纸序列设计算法(DAEDALUS)实现这一切。这个算法将确定所需要DNA折纸序列设计算法的碱基的具体顺序,就像提供了一个“脚手架”,然后一个DNA单链将围绕着它进行弯曲和缠绕,形成所需的形状。科学家要做的是提供带封闭曲面的3D形状(比如多面体、圆环等),然后将其输入计算机,并规定好规格范围。
下面就是科学家设计出的各种迷人的DNA形状(这些照片是用3D单粒子低温电子显微镜拍摄的):
科学家表示,研究这种DNA 3D结构,将可以用于输送药物、制造像CRISPR Cas9基因编辑元素这样的封装工具,甚至可以存储信息。这种方法的应用意义甚至将大大超越医学和基因编辑领域。
这项科研成果已经发表在了5月25日的《科学(Science)》杂志上。
翻译整理自techcrunch.com,原文作者Devin Coldewey